蜂巢的保存方法主要取決於其狀態（是否含有蜂蜜）和預期的保存時間。以下是一些常用的蜂巢保存方法：
低溫保存。將蜂巢放在冰櫃冷藏室中，可以保存3個月左右；若放在冷凍室中，則可以保存1年到5年不等。在保存前，最好用保鮮膜包裹以避免受潮。
常溫保存。如果蜂巢不含蜂蜜，可以在乾燥、通風且避免陽光直射的地方保存，一般可以保存數周到數月。
真空保存。使用真空包裝可以延長蜂巢的保存時間，在真空狀態下，蜂巢可以保存3到5年。
乾燥和避光。確保蜂巢處於乾燥、避光的環境中，以防止變質或吸濕。
使用玻璃或陶瓷容器。存放蜂巢的容器最好是玻璃或陶瓷材質，因為蜂巢具有弱腐蝕性，可能與塑膠或金屬容器發生反應。
密封保存。將蜂巢放在密封性良好的容器中，取用後及時封蓋，避免空氣進入。
此外，開啟後的蜂巢容易吸收周圍異味，應遠離刺激性物質如大蒜、洋蔥、酒精等。正確的保存方法對於保持蜂巢的品質和延長其保質期非常重要。